邵帅
发布时间:2023-03-06   访问次数:1713

邵帅


生物工程专业:硕士生导师

 


研究方向:

基于多组学技术研究感染过程中肠道病原菌与宿主互作机制,尤其是病原菌III型分泌系统(T3SS)介导的代谢感知、代谢利用和逃逸营养免疫的分子机制系统解析病原菌利用T3SS分泌的~30多种效应蛋白干扰和调控宿主细胞代谢过程和免疫系统的分子机制,及其形成的胞内效应蛋白网络打。

开发CRISPRi-seq技术,建立全基因组范围的必需基因和非必需基因基因系统敲降平台,结合课题组开发的PACE算法,从感染进程和不同组织/脏器维度系统鉴定病原菌感染/定植宿主所需的基因及功能,鉴定和优化减毒活疫苗靶点组合,指导鱼类疫苗的理性设计。

针对水产养殖病毒性病原,建立适合经济鱼类的mRNA疫苗分子设计策略,开发具有自主知识产权的鱼用核酸疫苗。


主持或参加的科研项目或基金:

国家自然科学基金青年基金, 32002436主持,2021/01-2023/12

上海市青年科技英才扬帆计划, 20YF1411100主持,2020/07-2023/06

博士后国际交流计划引进项目, 2020M671034主持,2020/01-2021/12

中国博士后科学基金面上项目, 2020M671034主持,2020/09-2022/09

国家自然科学基金重点项目, 32002436项目骨干2022/01-2026/12

国家自然科学基金面上项目, 42176238项目骨干2022/01-2025/12

科技部政府间(中韩)合作项目, SQ2021YFE011645项目骨干2021/03-2024/02

上海市技术发明带头人项目, 21XD1431900项目骨干2021/01-2023/12

青岛海洋科学与技术试点国家实验室前沿技术自由探索项目, 鱼类mRNA 疫苗关键技术研究,11-04项目骨干2022/08-2024/07


教学:

生物信息学(生物科学专业)


代表性论文(*通讯作者):  

1. Shao S, Zhang Y, Yin KY, Zhang YX, Wei LF, Wang QY*. FabR senses long chain unsaturated fatty acids to control virulence in pathogen Edwardsiella piscicida. Mol Microbiol. 2022, 117:737-753. (第一作者)

2. Shao S, Li CL, Zhao LY, Zhang YX, Yin KY*, Wang QY*. Interplay between ferric uptake regulator Fur and horizontally acquired virulence regulator EsrB coordinates virulence gene expression in Edwardsiella piscicida. Microbiol Res. 2021, 253:126892.

3. Shao S#, Wei LF#, Xia F, Zhang YX, Wang QY*. Defined mutant library sequencing (DML-Seq) for identification of conditional essential genes. Bio Protoc. 2021, 11:e3943.

4. Xu ZH#, Shao S#, Ding ZH, Zhang YX, Wang QY, Liu XH, Liu Q*, Therapeutic efficacies of two newly isolated Edwardsiella phages against Edwardsiella piscicida infection, Microbiol Res. 2022, doi:10.1016/j.micres.2022.127043.

5. Mao QQ, Jiang JH, Wu X, Xu RJ, Ma Y, Zhang YX, Shao S*, Wang QY. Coordinate regulation of carbohydrate metabolism and virulence by PtsH in pathogen Edwardsiella piscicida. Appl Microbiol Biotechnol. 2022, 106:2063-2077.

6. Zhang RY, Xu WS, Shao S*, Wang QY. Gene silencing through CRISPR interference in bacteria: current advances and future prospects. Front Microbiol. 2021, 12:635227.


发明专利:

1. 爱德华氏菌特异性噬菌体和其组合物及其应用,CN202111661595.1

2. 分离的杀鲑气单胞菌噬菌体、其组合物及应用CN113528461A

 

联系方式:

实验十八楼815

shaoscott@ecust.edu.cn/shaoscott@163.com

13166042695